Rendez vous dans la dernière salle du Great Zero qui est la salle de calibration et cliquez sur l'un des quatre appareils de calibration pour accèder au tableau des 14 missions à effectuer.
Pour chaque mission, cliquez sur le symbole clignotant, puis partez à la recherche du nombre de marqueurs mentionnés. Les marqueurs se trouvent dissimulés dans l'ensemble des lieux de la cité d'Aégura. Suivez votre progression à l'aide de votre KI. A la fin de chaque mission, il faut à nouveau utiliser l'appareil de calibration pour la valider. Le temps de recherche est alors mentionné et vous pouvez passer à une autre mission.
Lorsque le tableau est complet le calibrage de votre Great Zero est achevé.